Странное у вас сочетание мест заземления ... Всегда так было? А зачем, если не секрет, выполнено так? Что-то железнодорожное? С отключенными вторичными цепями делали опыт, включали? Тот же эффект? Это новая ПС, наладка, или она уже работала ранее? Может, схема вторичных цепей типовая, есть КЗ во вторичных цепях, но эта цепь не защищена автоматом, и перегорает предохранитель на стороне ВН? Но это было бы не мгновенно, мне кажется ... Я бы тщательно проверил вторичные цепи на наличие ещё одной (других) точек заземления или нарушения изоляции. Может, подключили какой-то новый прибор в цепях напряжения? Попадались мне измерительные преобразователи, у которых нейтраль цепей напряжения была заземлена, вернее, плохо изолирована.
Сам ТН уже был под напряжением, исправен, нет сомнений? Можно ещё от трёхфазного генератора 0,4 кВ подать напряжение на ТН, будет такой опыт ХХ. ВАФом будет видно, можно снять диаграмму. А при пониженном напряжении, скорее всего, предохранитель не перегорит.
В принципе, если других точек заземления во вторичных цепях нет, то всё равно, какие точки заземлять во вторичных цепях. Если эти точки - только здесь, в шкафу ТН.
Леденящая кровь история вспомнилась мне. Включали ТН 220 кВ, опыта ХХ от пониженного напряжения не делали. Поставили под напряжение, пошли снимать диаграммы, пока пришли в шкаф ТН - оттуда дым валит, горит изоляция. Монтажники подключали выводы по порядку А, В, С, N. Первая, вторая клемма и т.д. по порядку. А в шкафу уже стояла заводская перемычка между В (клемма 2) и землёй (клемма 3). Получилось КЗ фаз В и С, причём ещё до всех автоматов. А предохранителей у такого ТН на стороне ВН нет. ТН списали, большой скандал вышел. Я там другим занимался, но меня очень впечатлило. С тех пор к наладке цепей ТН очень тщательно относился, вот уж истинно - "лучше перебдеть". Забавно, что и месяца не прошло, при наладке ТН 500 кВ нашёл и вторую землю, и обрыв в самом ТН (оторвалась гибкая шинка по пайке и касалась бака электромагнитного элемента). Очень был благодарен своей впечатлительности :)