И дальше без него работаете?

Предложений, к сожалению, немного.
- Раговаривать с поставщиком (данное реле - закрытая система и сами вы ничего не исправите).
- Если первое не помогает, то продолжать квитировать и в будущем ставить беспроблемную моноблочную систему.

Не работал с таким блоком.

Вопрос такой, ключ даёт сигнал на "мамку", от "мамки" идут 6 оптических пар.
Каким образом квитируете, какую пару отключаете?

Вопрос два, не может ли такого быть, что в втором сете уставок есть уставка что долбит систему?
Проверьте соответствие первой и второй группы уставок по каждому параметру.

Коллега, не знаю почему, но имхо смена уставок должна идти через вход центрального модуля, а не перефирийного.
Сама логика процесса так подразумевает, не пинайте, я могу помочь только идеями.

Что говорят Алстомовцы??

Было похожее на других реле. Проблема в нежности обращения с оптическими коннекторами. Разъемы FC любят правильную ориентацию и закручивание до упора, иначе воздушный зазор дает сильное ослабление сигнала, особенно на желтых  (однмодовых) шнурках. Так же была попытка использования шнурков не того калибра, т.е. одномодовых вместо многомодовых. На небольших расстояниях прокатывало, но работало на границе устойчивости.