Если защиту блокируют или отстраивают от тока качаний, значит ток может быть большой. И качания пишут могут длиться секунды...

Кто пишет? Да если серьезные качания продлятся две секунды, вся система развалится. Другое дело - малые качания, которые не требуют блокировки дистанционных защит.
Далее. Если доверить деление системы при качаниях дистанционной защите, она может поделить ее в самом неподходящем месте, где по одну сторону - большой дефицит мощности, по другую - избыток. Деление системы возлагается на другие устройства, размещаемые в определенных точках.
Токовая защита без выдержки времени (отсечка, то бишь), должна быть отстроена от максимальных токов при качаниях или асинхронном ходе. Другое дело - дистанционная защита, на которую с одной стороны действует снижение напряжения (если электрический центр качаний находится в точке размещения защиты - то до нуля), с другой - превышение тока (на обоих концах транзита векторы напряжений находятся в противофазе, аналог КЗ).

Оборудование действительно подвергается большим токовым перегрузкам при СК и АР, но как говориться "на войне у каждого своя работа" - то бишь выполнение требований по селективности - каждое устройство должно работать только в том режиме на который оно рассчитано: РЗ с токовыми "аномалиями", а АЛАР с СК и АР.
Ведь, если АЛАР сработает на ресинхронизацию и синхронная работа ЭС восстановится, то колебания исчезнут и исчезнут перегрузки. А вот, если хаотично начнут срабатывать РЗ и отключать  ВЛ все подряд или методично по одной, то это только может только усугубить системную аварию. 

Уточняю.
Экстремум тока при синхронных качаниях действительно большой, так как вычисляется примерно по следующей формуле: I = (U1 - U2)/Zл, где U1, U2 - вектора напряжений, поэтому при угле между ними 180 гр будет двойной ток, который естественно может превысить и ток КЗ в конце линии, в обратной же фазе (0 гр) при равенстве напряжение значение тока вообще будет ноль. Это колебания и превышение временное и зависит от периода асинхронного режима, например если брать, что половина значения синусоиды при 30 гр и это равно значению тока перегрузки или КЗ, то относительное время превышения будет составлять 5/6 периода качаний или АР. Поэтому, нужно отстраиваться именно от этих временных превышений, защита запускается, но не должна  успевать сработать. Длительность самого переходного процесса  не имеет значения, он может длиться с момента аварии (КЗ) - 2...5 с, да и значительно дольше... 
Понятно, что для разных защит и используют различные блокировки. Для токовой как и описано - по времени.
Для дистанционных применяют специальный орган так или иначе выявляющий наличие асинхронного режима: чаще, периодическое изменение сопротивление (в иностранной литературе встречается как "защита от вращающегося поля"), если он выявил наличие колебаний сопротивления, то первые ступени ДЗ блокируются.

И так всё понятно, но что-то не могу припомнить АЛАР-ы на электромеханике, хотя верю, что где-то ещё стоят и АПАХ и САПАХ - качалки...
Вы не много попутали, речь идёт о необходимости блокировки РЗ при ск и ар, а не о блокировке АЛАР от КЗ.
В 2002 г году лично переводил документацию АВВ REL 541, если помните это было самое начало ... ни МП РЗ ни МП ПА в РФ ещё не было...

Суть замечания в чём?! High-Voltage! Выходит Саня прав! или, что ....
А про то, что Вы говорите по РФ было 0,02%, на ДВ - 0,001%