Обычно уставки диф.защит трансформаторов задаются в относительных единицах, приведенных к номинальным параметрам защищаемых трансформаторов, т.е. In - это номинальный ток трансформатора во вторичных величинах, с учетом возможной, но маловероятной сборки токовых цепей в треугольник, что требует учета коэф.схемы равной 1,732
Эти вторичные номинальные токи, соответствующие протеканию через него номинальной мощности, сейчас чаще всего называют базовыми или базисными. Руководство на БЭМП писали те ещё писатели 
:)
Путь примерно такой (это для автора вопроса): вычислить первичные номинальные токи сторон тр-ра при протекании по нему номинальной мощности, затем вычислить вторичные токи с учётом фактических Ктт установленных ТТ и схемы их соединений (сейчас это чаще всего звезда или неполная звезда) - в результате получаются базовые токи сторон. Вот они и являются тем "базисом" (каждый для своей стороны тр-ра), от которого рассчитываются токи, подаваемые в терминал (повторяю, для каждой из сторон - "свои" величины тока, ведь базовые токи, скорее всего, различаются).