Единственное, что навскидку предполагается - в этом случае величина получается максимально возможной (как если бы все нейтрали заземлены), нет нужды пересчитывать отстройку при изменении режимов заземления нейтралей трансформаторов  в сети.

В расчете участвуют все трансы с заземленными нейтралями, по крайней мере, для однофазного включения (и для двухфазного вроде тоже - иначе от них тока НП не будет). Учитывают ли обычно в расчете трансы, нейтраль которых в данный момент не заземлена - хз, но лучше учесть, действительно, мало ли что. Тем более, если это неопределяющее условие.

Заземление нейтрали при решении вопроса, какой схемой пользоваться - прямой последовательности или нулевой - роли не играет. Потому что на самом деле нужно для расчета ТОКА рисовать ВСЕ ТРИ схемы (прямой, обратной и нулевой последовательности). Если мы знаем только схему нулевой последовательности, а прямой - нет, то ничего мы не посчитаем никогда.

Как я уже писал выше, при однофазном включении по идее надо брать сопротивление одной фазы ZL (это как раз тот случай, когда про метод симметричных составляющих лучше забыть). Оно больше, чем сопротивление прямой последовательности (ZL≈0,7 Ом/км). Вероятно, чтобы не пересчитывать еще раз все сопротивления систем и схему замещения, берут сопротивление прямой последовательности (Z1≈0,4 Ом/км) для упрощения.

Симметричная трехфазная линия представляется тремя фазами с сопротивлением ZL≈0,7 Ом/км, между которыми существует взаимоиндукция  Zm≈0,3 Ом/км.

Сопротивление прямой последовательности Z1=ZL-Zm≈0,7-0,3=0,4 Ом/км

Сопротивление нулевой последовательности Z0=ZL+2Zm≈0,7+2*0,3=1,3 Ом/км

Бросок считают по схеме прямой последовательности. Почему именно так-сложно сказать, вероятно, это какое-то упрощение.

Единственное, что навскидку предполагается - в этом случае величина получается максимально возможной (как если бы все нейтрали заземлены), нет нужды пересчитывать отстройку при изменении режимов заземления нейтралей трансформаторов  в сети.
А задумался о режиме нейтрали именно потому, что конкретная задача с землей в конкретном месте. И от режима нейтрали бросок именно ТНП будет зависеть кардинально.

Бросок считают по схеме прямой последовательности. Почему именно так-сложно сказать, вероятно, это какое-то упрощение.

Мое предположение: в РУ рассчитывают случай броска в одной фазе трансформатора (однофазное включение). В этом случае  токов в двух других фазах нет (они отключены), и тогда нужно брать сопротивление петли фаза-земля (РУ11, формула 2-63, стр. 36). Для линии оно равно 0,145*log(Dз/r)=0.145*log(1000/0.011)=0.72 (я взял радиус провода 11 мм, это АС-240/39). При других диаметрах провода цифра все равно где-то порядка 0,7.
Вероятно, чтобы не забивать этим всем голову, берут сопротивление прямой последовательности (примерно 0,4 Ом/км), создавая, тем самым, расчетный запас.