Практика нередко подбрасывает интересные проблемы. Гляньте на страничку http://dororz.ru/gra_10.htm, созданную по сообщениям одного знакомого релейщика. Два случая связаны с проблемами изоляции, третий - с нетрадиционным выполнением схемы автоматики. Ну никак здесь заочно не поставишь диагноз.
Если защита выполнена на электромеханике, начинать нужно с изоляции вторичных цепей, если микропроцессорная - смотреть осциллограммы. Релейщика местного привлекать нужно.

Я думаю, что вы и сами понимаете, что причину установить все же необходимо. 
Я тоже задался вопросом - это происходит когда линия отключена?

Мне тоже известны случаи, когда блинкеры подрабатывали из-за вибрации. Бывает просто закрываешь релейный отсек и блинкер выпадает. РУ-21 менее подвержены этому, но также наблюдалось.

Вы присутствовали лично при комплексной проверке алгоритма УРЗА после работы блинкера? Может там в схеме что-то закралось, выполняли какой-нибудь перемонтаж недавно или еще что-то ковыряли.
Что за тип блинкера?

По этому поводу припоминаю интересный объект чуть ли не сорокалетней давности. Чигиринская ГРЭС в Черкасской области на берегу Днепра. На стройплощадке вводим временную относительно мобильную подстанцию 35/6 кВ. Произведена в Польше, предназначена для освоения нефтегазовых промыслах на болотах. Когда впервые вошел в КРУЭ и неосторожно хлопнул дверью, отключились все включенные выключатели и включились все отключенные, у которых были заведены приводы. Естественно, выпали все блинкеры.
Неделя работы совместно с подстанционщиками привела к сохранению положения выключателей. Но вот для того, чтобы перестали выпадать блинкеры, пришлось выполнить сложную систему организационно - технических мероприятий, включающую вывешивание плакатов на дверях примерно такого плана: "Хлопнешь дверью - получишь в рыло!". Амортизаторы дверей, естественно, не были забыты.