Навскидку могу сказать:
1) уставки ДЗ и ТЗНП скорее всего придётся пересчитать, в частности последние ступени.
2) для отстройки от КЗ за трансформатором лучше поставить комплект КРС-121, т.к. он правильно реагирует на КЗ за "треугольником".

Сейчас для блокировки надо применить БРЭ-2801 или на худой конец КРС-2 и дополнительно установить Рто, которое разрешает работу ДФЗ при КЗ на землю. КРС 121 и 131 это прошлый век. Даже при желании их поставить вы их вероятно нигде не найдете.

Трансформатор включен через выключатель. Схема 4H. Нейтраль заземлена.

Согласовывать как я понямаю только по времени. С питающих концов 3ст. ДЗ 2,5с и 4,5с. МТЗ-110 2с.
Теперь вопрос про дальнее резервирование. Если мне будет необходимо резервирование транса, то я буду меня уставку 3ст. ДЗ? а если нет, то я не трогаю её?.

ТЗНП также без изменений оставляю

Ошиновка не защищается ни МТЗ ни ДЗТ

Судя по всему, запугал.  :(
Да нет ничего особенного. Просто надо согласовать 3 зону ДЗ ВЛ с МТЗ 110 трансформатора для двух вариантов. Первый – без резервирования КЗ за трансформатором, второй – с резервированием КЗ за трансформатором , что не всегда возможно выполнить.
Про ошиновку 110 кВ. Я имел ввиду ошиновку от выключателя до трансформатора. В схеме 4Н в ячейке выключателя со стороны ВЛ устанавливаются ТТ и если дифзащита и МТЗ включены на них, то надо иметь ввиду, что при КЗ на этой ошиновке будут работать одновременно дифзащита трансформатора, отключая свой выключатель и первые ступени защит ВЛ (ДЗ и ТЗНП) на питающих ПС. Эту неселективную работу защит надо оговорить в уставках защит ВЛ, с указанием, что АПВ ВЛ исправит это  неселективное действие. А вот если дифзащита включена на ТТ встроенные в трансформатор, а МТЗ на ТТ выключателя, то потребуется согласование защит ВЛ (как ДЗ, так и ТЗНП) с МТЗ 110 трансформатора . Но такое подключение защит надо пресечь на корню. Так же как и режим заземления нейтрали трансформатора. Чем обосновывают необходимость заземления нейтрали трансформатора? Сдаться можно если трансформатор с ослабленной изоляцией нулевой точки или есть источники питания на стороне НН/СН.

Ну так на ВЛ ПС А – ПС Б на ДФЗ блокирующие органы должны уже быть.
Формулы расчета уставок дополнительных реле даны в РУ-9 в таблице №9.
Так для  Z ср 24РС в схеме на рис.9 по табл. 9, п. 4 это формулы: 69, 70, 78, 79. Выбирается меньшая величина.
Проще, можно взять равным уставке 1РС, только проверить, что за трансформатор отпайки не лезет или 2*Zвл с той же проверкой. При длине ВЛ 15-20 км и Sтр=16 должно получится.
Да еще надо проверить I пуск/I откл на отстройку от КЗ  за трансформатором. Ну, пусковой еще можно допустить, что чувствует, а отключающий нельзя.
Теперь о заземлении нейтрали на трансформаторе отпайки. Такое дело на самотёк пускать ни в коем случае нельзя. Поскольку не знаю Вашей сети, то в случае заземления нейтрали на трансформаторе отпайки, считаю нужно проверять уставки ТЗНП всех ВЛ отходящих от шин ПС А, Б, В., а не только ВЛ А-Б и ВЛ В-Б.

Дополнение:
О том какие сюрпризы можно ждать от ТЗНП на парллельных ВЛ при заземлении нейтралей трансформаторов на отпайках описано в "РУ №12 Расчеты ТЗНП ВЛ 110 - 500 кВ." Приложение IV стр 66 и приложение VI стр 77.

В таком случае, кто предлагает, то пусть и считает уставки. Ставить надо не то, что есть на складе, а то, что обеспечивает правильную работу защиты. Кроме ДЗ нужен еще дополнительный блокирующий орган реагирующий на 3Io.
ЛЗШ – это логическая защита шин? Если да, то она блокируется или замедляется при срабатывании  МТЗ отходящих ВЛ. Уставку по току надо согласовать с максимальной уставкой МТЗ отходящей ВЛ, чтобы ЛЗШ не пускалась раньше, чем МТЗ на отходящих ВЛ.
Да. РУ, + рекомендации производителей новых устройств РЗА, полученные с техдокументацией или на курсах обучения. А чем Вам не нравятся существующие РУ? В них заложены основные принципы расчетов алгоритмов устройств РЗ. Меняется материальная база, так  Квозврата  для РТ-40 =0,8, для МП устройств можно принять 0,95.  Принципы же остаются прежние, по крайней мере, для устройств Российских производителей.

Вы правы.
Но отстраиваться от КЗ на ошиновке ВН трансформатора ее нецелесообразно.  Это существенно сократит 1 зону ДЗ и повлечет изменение всех ДЗ на смежных ВЛ. А ежели эта отпайка под «носом». Кстати ДФЗ в этом случае тоже будет срабатывать. АПВ должно исправить. Это можно включить в перечень неселективной работы защит. Но то же лучше не надо, перечень шибко раздуется. Тем более что после отключения ВЛ -  первая команда диспетчера  - это осмотреть оборудование ПС, в том числе и отпаечных.

Был случай, когда ОВБ дважды включала трансформатор на отпайке разъединителем после того как там включался КЗ 110 и отключался ОД-110 и линия дважды отключалась с неуспешным АПВ от ДЗ на питающих ПС. И только после этого ОВБ обнаружила блинкер дифзащиты трансформатора.