А можете схему привести с указанием второй точки заземления и токов в фазах и в нуле? Там постараюсь обосновать, просто гадать не хочется. При несимметричной нагрузке вполне возможны такие вещи.

Нагрузка симметричная во вторичных цепях?
Возможно есть перекос на какой то линии по первичке, а если он есть, то по нейтралям трансформаторов будут протекать токи нулевой последовательности, соответственно и по контуру ПС тоже.

Без схемы ПС и векторным диаграммам по присоединениям остается только гадать.
Но все же я думаю, что небольшой перекос существует. Как вариант, если есть ТТ в нейтрали трансформатора, то можно посмотреть его обтекание. Если конечно выводы этого трансформатора выведены в клеммную коробку.
Какое значение тока вы намерили в нуле?

То есть, основное заземление - в клеммном ящике ТТ, а второе - на релейном щите?
Скорее всего, гнилой контур заземления. По нему должны замыкаться всякие побочные токи. А когда контур прогнил, они замыкаются по токовым цепям. Объект какого возраста, кстати?

Keksnoip, какие значения токов были до подключения второго заземления в фазах и нуле?
Какие значения токов были после подключения второго заземления в фазах, в нулевом проводе, который идет от клеммы к ТТ, в нулевом проводе который идет от клеммы к реле, в проводе заземления на релейном щите, в проводе заземления в клеммам ящике ТТ?
Если есть возможность, то сообщите вектора токов.
Какое номинальное напряжение оборудования?

Если расстояние большое, то вполне возможно, что этот ток представляет собой емкостный ток длинного кабеля относительно "земли" или относительно соседних кабелей, контур которого замыкается через две точки заземления.

Замеров никаких больше к сожалению сделать не могу

Именно об этих причинах и хочется узнать. Где-то краем уха слышал просто что ток в нулевом проводе при двух точках заземления появится не от перекоса нагрузки, но потому что через землю ток идёт к нейтрали трансформатора. Собственно здесь я хочу получить однозначный ответ: Откуда там может взятся ток? Пока я получил ответ что это токи небаланса текут к нейтрали через токовые цепи. Это единственный возможный вариант при таких условиях? Т.е. при полностью симметричной нагрузке на подстанции - тока в нейтральном проводе не будет? (Емкостные токи исключаем, не те расстояния и силы токов)

В принципе согласен с этим, но у меня была мысль, что при нормальных условиях (полная симметрия, никаких аварийных режимов и наводок), при установке второго заземления происходят какие-то неизвестные мне физические процессы(вдруг во вторичке на фазах токи меняются? Или появляется разность потенциалов на точка заземления при прохождении тока) в общем меня интересует что будет если заземлить в двух точках нейтральный провод при лабораторных (идеальных), а не реальных условиях. Исходя из ваших ответов следует - что тогда в нейтральном проводе токов не будет. Ничего не упускаю?

Спасибо! отличное объяснение!

А вот это конечно сильно!
При прогрузке токами нового оборудования попробую заземлить токовую цепь в двух местах, и провести измерения. Есть непроверенные данные что ток в фазах тоже изменится. О результатах измерений обязательно отпишусь