1) Вручную - это не вариант, если есть АРМС.
2) Торопиться здесь, игнорируя возможности программы и считая по старинке - архиглупо. Убедился на своей шкуре. Забудьте про "сроки" и "надо быстрей, давай пока что вручную" - ни разу будет не быстрей.  Раз так в 10 будет не быстрей.
3) какие вкладки вам доступны? (Есть хотя бы расчеты ТКЗ или лучше "релейная защита"?).

По теме.
1) Разберитесь по хелпу, как рисовать в АРМ СРЗА. Это несложно, там объяснено все достаточно популярно. Если смогли научиться считать вручную, то проблем быть не должно. Рисуете узел 1, рисуете узел 2, рисуете ветвь 0 1-2. Если есть еще ветви между 1 и 2, то они будут называться 1 1-2, 2 1-2 и т.д. Задаете тип ветви, разберитесь, какие есть. Выключатели (1 или 101) рисовать по концам ветви не надо, ее можно коммутировать приказами. Если вы указали только сопротивление прямой посл., то сопротивление нулевой будет бесконечность, и наоборот.
Самая затыка - это как рисовать трансформатор. Можно по-разному, но лучше так, чтобы было нагляднее. На примере трехобмоточного: рисуете три ветви звездой, как обычно. Та ветвь, которая заканчивается "треугольником", в конце должна иметь шунт на землю. Сопротивление шунта по прямой посл. - бесконечность (99999999...), по нулевой  - ноль, тип ветви 1, если нейтраль заземлена или 101, если разземлена. Чтобы такую ветвь нарисовать, проще всего задать вначале ей тип 0, написать рандомную цифру (не ноль) в окошко R1 или X1, далее сменить ветви тип на 1 или 101. Та ветвь, которая заканчивается "звездой" с комп. нейтралью, в принципе, по нулевой последовательности заканчивается разрывом.

2) Пример расчета тока фазы А во вкладке ТКЗ
Примерная схема:
Es-1------2-------3-Er

ВЕЛИЧИНА IA UA
ВЕТВЬ 0 1-2
УЗЕЛ 1
НСМ 1
ВИД-КЗ АВ
УЗЕЛ-КЗ 2
ПОДРЕЖИМ 1 /*это обычный режим
ПОДРЕЖИМ 2 /*это режим с откл. ветви 0 2-3
ОТКЛ 0 2-3

Если вы разберетесь в этом (а это несложно), и если у вас есть вкладка "Релейная защита" -пишите сюда, попробую продолжить.

Продолжу:)
Расчет РЗ лучше всего делать через вкладку "Релейная защита", если это защита с относительной селективностью (т.е. ДЗ, ТЗНП, ТО...). ДФЗ, по-моему, лучше считать через вкладку ТКЗ.
В АРМ СРЗА есть целая куча команд в "панели задания на расчет" (через правую кнопку мыши). ИМХО, большая часть из них малополезна. Там есть возможность задавать уставки защиты через приказ... Это ненаглядно, неудобно и отнимает время. Проще всего использовать фонд РЗ.

На вкладке графического редактора щелкните по линии, у нее должно быть свойство Nэл. Это номер элемента, поставьте, скажем, 1. Элементом можно сделать не обязательно одну линию - можно и несколько, допустим, если линия с отпайкой, то отпайку тоже лучше отправить в элемент (не сам трансформатор отпайки имеется в виду, а ЛИНИЮ от места отпайки до шин ВН отпаечной ПС).  Трансформатор тоже можно сделать одним элементом, все ветви. Соответственно, разные линии должны иметь разный Nэл.

Также в этом же окошке со свойствами линии есть Nз1, Nз2. Это номера защит. На одном элементе, получается, можно воткнуть 2 защиты.  Поставьте, скажем, в окошко Nз1 цифру 1. После чего вынесите Nэл, Защ1 (там есть кнопки) на схему и поставьте примерно туда, где она должна быть (в начале линии, грубо говоря). Номер защиты определяется как NэлNзащ, т.е в нашем случае будет элемент 1, защита 1 и ее номер будет 11. Если элемент 10 и защита 2 то будет 102.

Квадратик с номером защиты доступен для редактирования из вкладок "Графический редактор" и "релейная защита". Да, для начала вам нужно создать фонд защиты (Фонд РЗ=>Новый фонд).
После этого заходите в квадратик и ставьте нужные типы панелей. Там есть список. Допустим, это будет ШЭ2607 (сферически-вакуумный пример защиты с многоугольной характеристикой) и ТЗНП. Зайдите в свойства, проставьте нужные цифры, если они у вас есть (допустим, у вас уже часть защит с уставками есть, надо согласовать). Для ТЗНП можно выбрать напряжение и ток срабатывания органа направления мощности. В хелпе есть инструкция, как это делать, если не сделать, при проверке чувствительности будут использованы какие-то значения по умолчанию. В принципе, для начала сойдет, они все примерно одинаковые.

Выставьте все защиты, какие у вас есть, в фонде. Введите все существующие уставки, какие будут нужны. Далее можно приступать к расчету.

Рекомендую файл расчета структурировать. Иначе потом будет километровая стена текста, для понимания малодоступная. Грубо говоря, на пустой строке ставьте звездочку * и комментируйте, что это и для чего.
Допустим, надо посчитать первую ступень ДЗ. Используйте знаки типа -, =, % для того, чтобы отделение было более видным. При структурировании нужно ставить эти разделители так, чтобы получить независимые блоки (отстройка, согласование и т.п.) Их можно будет закоментить с помощью / и пускать порознь. Тогда, набрав 1 раз приказ, можно будет потом его перезапустить, если что-то вдруг понадобится, совершенно не напрягая мозг.
Пример расчета. Все приказы типа ЗАЩИТА, ОТСТ и т.п. берутся из правой колонки. Комментарии справа через /* можно потом будет не писать, это чисто мои замечания.
Схема та же, что и в пред. посте. Линия 0 1-2  имеет номер 1, 0 2-3 имеет номер элемента 2. Номера защит на обоих элементах 1, т.е. есть защита 11 и 21.

Вначале посчитаем ДЗ на линии 0 2-3. Нам будет нужно обеспечить чувствительность через переходное сопротивление. У вас линия с односторонним питанием, но я приведу вариант для двустороннего, чтобы было ясно.

1) Считаем переходное сопротивление в месте повреждения. Формулы все разные, + ветер и т.п.  Rд=Uд*Kв*L/Ik. Uд=2500 по Сименсу, также есть цифры 1800, 2200, 2430, 1050. Последняя цифра -наши отечественные РУ. Кв - коэффициент раздутия ветром, для ст. 1 можно принять 1, для последующих он больше (2...10). Можно просто не париться и взять 2. Можно взять цифры, которые где-то на форуме приводил CLON:
Для сети 110 кВ расчетное сопротивление принимаем: междуфазное КЗ Rд=2 Ом, а однофазное КЗ Rд=5 Ом,
Для сети 220 кВ расчетное сопротивление принимаем: междуфазное КЗ Rд=4 Ом, а однофазное КЗ Rд=10 Ом,
Для сети 330 кВ расчетное сопротивление принимаем: междуфазное КЗ Rд=5 Ом, а однофазное КЗ Rд=14 Ом.
СОпротивление R1 выбираем по чувствительности к концу зоны ДЗ-1: при КЗ на 0.85 линии, с заданным переходным сопротивлением уставку выбираем как замеренное сопротивление х 1.2 (коэффициент чувствительности). По аналогии берем для остальных зон, но для 3 и 4-ой в каскаде.
Для 1-ой и 2-ой зон обязательно учитываем ток подпитки с противоположного конца линии. Так же вводим искусственные ограничения значений R1 для фаза-фаза не более 3 Х1, а для фаза-земля не более 5 Х1.
L - длина дуги, для межфазных -расстояние между фазами, для КЗ на землю - длина изолятора+ надо будет прибавить сопротивление заземления опоры. Можете почитать книжку Циглер Цифровая дистанционная защита, там есть, стр 131. Где-то 0,5 Ом выходит, берите только активную часть для надежности.

Однако имейте в виду, все на практике зависит от уровня ТКЗ в сети. У меня с цифрами CLONа и уровнями ТКЗ под 40 кА на шинах даже жалкие 2 Ом дали громадную уставку по R. В сущности, плохого ничего нет... но кое-кто может поднять вой. Так что лучше просто потыкайте ваш сетевой район, посмотрите примерный уровень ТКЗ, возьмите ориентировочное значение Rд из тех, что побольше. Если у вас куча коротких линий, можете взять одно значение (большее) для них и все. Не надо запариваться и высчитывать Rд для каждой линии, цифры эти "среднепотолочные" и плюс-минус 0,5 Ом погоды не сделает. Режим можете брать нормальный, не надо париться и отключать кучу всего.  Отключение подпитки даст увеличение Rд, но снизится его влияние на замер сопротивления. Для защиты от межфазных КЗ смотрим токи двухфазного КЗ, для КЗ на землю - однофазного.

2) Считаем нагрузочный режим (ТОЛЬКО ДЛЯ ЛИНИЙ С ДВУХСТОРОННИМ ПИТАНИЕМ). Задание-панель установки режима. Вводите вашу линию в "Начало участка". Задаете напряжение в начальном узле (допустим, 220 кВ), задаете ток (макс. нагрузка х Кн), Кн где-то 1,2 можно взять. ВНИМАНИЕ: если у вас двуцепа, макс. ток, скорее всего, относится к ОДНОЙ линии. Поэтому проверять потом надо будет, когда включена одна линия, а не две. Или тогда делите ток нагрузки на 2. Нажимаете "считать", получаете что-то типа   НАПР-Г 1 220/0 2 220/-5. Эту штуку нужно вставлять в СНСМ (сложная несимметрия, почитайте хелп).
ВНИМАНИЕ: если вы зададите нагрузочный (доаварийный) режим через НАПР-Г для линии С ОДНОСТОРОННИМ ПИТАНИЕМ, то результат будет НЕПРАВИЛЬНЫМ. Ибо метод наложения в этом случае применять нельзя. Учитывать подпитку от нагрузки так тоже нельзя (все эти ЭДС 0,85 Х=0,35 и т.п.).
   
*=======ДЗ ВЛ 0 2-3 СТУПЕНЬ 1===========

ЗАЩИТА ЗАЩ=21 ВИД_ЗАЩ=ДЗ/*ДЗ ТЗНП МФТ*/ СТУП=1 КОМПЛЕКТ=1 /*это защита, которая рассчитывается
*------------ОТСТРОЙКА--------------------------------------
ОТСТ ЗАЩ=11 КН=0.87 /*обратите внимание, номер защиты тот же

НСМ=1 /*Несимметрия номер 1, для отстройки
ВИД-КЗ ABC
УЗЕЛ-КЗ 3

СНСМ 2 /*сложная несимметрия, для скоса Ф4, только для ВЛ с двусторонним питанием.
НАПР-Г 2 220/0 3 220/-5
ЗАМ-ФАЗ 3/AB(1 0)
ПОДРЕЖИМ 1 /*его можно в данном случае и не ставить, но лучше чтоб был. Так приучаешься к порядку. Если надо - можно тут что-то отключить и т.п. Заметьте, номера подрежимов в одном блоке не должны повторяться. НСМ и СНСМ тоже не должны иметь повторяющихся номеров, причем в плане нумерации НСМ и СНСМ одно и то же (нельзя задать НСМ=1 и СНСМ=1 одновременно).
*-------- ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ-------------------- (этот блок запускается отдельно от отстройки. Хотя после задания каких=то уставок можно и вместе.)
ЧУВС ЗАЩ=21 КТН=2200 КТТ=2000 JВТ=1 /*2200 -это коэфф. тр-ии ТН, 2000-ТТ, 1 -это вторичный ток ТТ. Номер защиты все тот же -21, ибо ее мы и проверяем (вернее, обеспечиваем чувствительность)

НСМ=3 /*несимметрия 2, для обеспечения чувств. по переходному сопротивлению
ПРОМ-УЗЛ 0 2-3 L=0.87 УЗП=P N=0 NN=0 NK=1 /*промежуточный узел на 87% длины
ВИД-КЗ AB(1 0) /*в данном случае Rд=1 Ом. Двухфазное черех 1 Ом.
УЗЕЛ-КЗ P /*Замыкание в промежуточном узле
ПОДРЕЖИМ 2

СНСМ 4 /*сложная несимметрия, для выбора уставки по направленности в 4-й квадрант (обеспеч. чувствительности при КЗ в месте установки защиты чере Rд). В принципе, обычно хватает дефолтной уставки.
НАПР-Г 2 220/0 3 220/-5 /*этот приказ здесь нужен только для ВЛ с двустор. питанием.
ПРОМ-УЗЛ 0 2-3 L=0 УЗП=P N=0 NN=0 NK=1 /*промежуточный узел на 0% длины (в месте установки)
ЗАМ-ФАЗ 3/AB(1 0)
ПОДРЕЖИМ 3 /*его можно в данном случае и не ставить, но лучше чтоб был. Если надо - можно тут что-то отключить и т.п.
*======ДЗ СТУПЕНЬ 1 ВЛ 0 1-2=========
... тут то же самое, только для защиты 11. 

Запускаем вначале блок ОТСТРОЙКА (закоментить блок ЧУВСТВ в начале и в конце с помощью /) через графический расчет. Появится окошко с областями уставок. Отстраиваемся. По вектору 1 задаем уставку по Х, по вектору 2 (тому самому, который возник с учетом предш. нагрузки) задаем Ф4. Уставка по R на этом этапе любая (оставляем дефолтную). Потом нажимаем "Запись в вых. док", и все это хозяйство окажется в протоколе. Далее находим нужное условие (в данном случае любое, двойной щелчок, запись в фонд. После этого защита будет иметь какие-то уставки в фонде.

Потом блок ОТСТРОЙКА должен быть закоменчен (хотя это уже необязательно, можно просто удалить лишнее из протокола), блок ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ раскомментируем. Будет два зеленых вектора с кружками на концах, Правую часть (уставку по R) тянем так, чтобы кружок на конце более длинного вектора (точнее, нижняя половина его) был внутри области. Если область по дефолту захватывает его с запасом -можно оставить так. Уставку по Х и Ф4 НЕ ТРОГАЕМ. Уставку по нижнему углу направл. в 4-й квадрант надо сделать так, чтобы второй вектор тоже лежал в уст. области. В принципе, по дефолту, как правило, так и будет.

Далее еще раз - запись в вых. документ, и еще раз "запись в фонд". Снизу есть специальное окошко для текстовых комментариев, можете туда записать, какие уставки принимаем. Далее можете ткнуть "Сохранить в формате rtf". Все. У вас протокол... Уф... Когда уставки уже есть в фонде, можно оба блока ОТСТРОЙКА и ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ пускать вместе, главное, чтобы там не повторялись подрежимы, НСМ и СНСМ. Можно вообще перед расчетом задать в фонд что-нито от балды.

Далее ступень 2.... Порядок действий тот же. Чувствительность по R нужно обеспечить в конце защ. линии. Весь блок по расчету пред. защиты закоментить. Звездочками и слэшем.
*======ДЗ ВЛ 0 1-2 СТУПЕНЬ 2 ============
ЗАЩИТА ЗАЩ=11 ВИД_ЗАЩ=ДЗ СТУП=2 КОМПЛЕКТ=1
*------------СОГЛАСОВАНИЕ-------------------------
СОГЛ ЗАЩ=11 КН=0.87
З-Б
*-------СОГЛАСОВАНИЕ С ЗАЩ. 21 %НАЗВАНИЕ ЛИНИИ%-----------------
ЗАЩ_Б ЗАЩ=21 ВИД_ЗАЩ=ДЗ СТУП=1 КОМПЛЕКТ=1
НСМ 1
ВИД-КЗ ABC
ВЕЕР 2/2 /*первая цифра - это номер элемента (2), вторая - номер стартового узла (2)
ПОДРЕЖИМ 1 /*обязательно. У меня, по крайней мере, без этого приказа прога начинает чудить.
/*Если есть еще линии, с кот. согласуем - сюда их. Запускать блоки согласования для разных линий надо по отдельности. Вначале запустили этот, потом закоментили, и т.д. Строки ЗАЩИТА, СОГЛ и З-Б оставляем все время активными
*-------ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ ПРИ КЗ В КОНЦЕ %НАЗВАНИЕ ЛИНИИ%------------
ЧУВС ЗАЩ=11 КТН=2200 КТТ=2000 JВТ=1.
НСМ 1
ВИД-КЗ AB AB(1 0) /* на этот раз -чувствительность как при металлическом, так и при КЗ через переходное.
УЗЕЛ-КЗ 2
ПОДРЕЖИМ 1
/*этот блок пускаем при закрытых блоках отстройки. строки СОГЛ, З-Б - закрыть *, ЗАЩИТА - не трогать.
Порядок действий здесь тот же.
Ступень 3 рассчитывается по чувствительности в конце смежных линий и отстраивается от нагрузки, если нет выреза или его запретили использовать. Отстройку от нагрузки делаем приказом НАГР. Примерно вот так:
ЗАЩИТА ЗАЩ=11 ВИД_ЗАЩ=ДЗ СТУП=3 КОМПЛЕКТ=1
НАГР ЗАЩ=11 КН=1.1 КВ=1.2 КСАМ=2 UМИН=200 JН=1000 ФН=30
Обеспечение чувствительности -точно так же, как и ранее. При этом нужно задать от балды какие-то уставки в фонд, чтобы приказ отработал (потому что приказ ЧУВС работает, только если хоть что-то задано).
Коэффициенты надежности, возврата, самозапуска и т.п. задаете сами.

Ах да, если вы все же решили ступень 3  с чем-то согласовать, то используйте приказ УЗ-КЗ_Х вместо ВЕЕР (т.е. будет, скажем, УЗ-КЗ_Х 3). Потому что согласовывать ступень 3 нужно будет тогда со ступенями, охватывающими всю линию, и их нужно будет вывести на грань срабатывания по Х в конце их собственной линии.
Ежели ступеней больше, чем 3, то 3-ю можно в определенных случаях заставить резервировать те смежные линии, по согласованию с кот. меньше выдержка времени. 4-я тогда резервирует все. Все это хозйство точно так же в протокол, комментируете, если надо, потом в rtf....

И еще. При КЗ за трансформатором при его схеме соединения Y/Д-11 вектор замера должен повернуться на 30 градусов вправо и увеличиться в 2/корень(3) раз, если не ошибаюсь. Воспользуйтесь шаблоном (Редактирование-вставить из файла) РС_ФОРМУЛА_КЗ_за_треугол. Будет как-то так..
ВКЛ_РС ФОРМУЛА
ЗНАЧЕНИЕ...
... (тут далее идет приказы из шаблона). Если защита у вас от межфазных, то строки с ZA, ZB, ZC можно удалить, и наоборот. Ибо не нужно захламлять файл текстом.

... Пока все, устал писать. Потренируйтесь, потом мб напишу в двух словах про ТЗНП (там почти то же самое все) и отвечу на вопросы.

Коллеги, если я что-то напутал, поправьте.

Читайте пост выше, там все написано)). Пункты 1) и 2)
Вкратце:
1) прикидываете переходное сопротивление (пусть будет R=2 Ом)
2) смотрите, какой предельный ток термической стойкости в линии (Допустим, I=1000 А).
Далее вы должны так задать ЭДС сети (модули и фазы), чтобы в доаварийном режиме через вашу линию потек ток 1000 А.
Далее нужно сделать КЗ с найденными величинами ЭДС. Обычно расчет ведется методом наложения.
Для всего этого используется метод приказ НАПР-Г и вкладка "Задание-панель установки режима".

По-моему, там достаточно общих знаний того, как считать ДЗ от КЗ на землю, чего-то сильно особенного у ЭКРЫ нет.
Коэффициент компенсации током нулевой последовательности у ЭКРЫ разделен на 2 составляющие - активную и реактивную, и расчетная формула для ДЗ от КЗ на землю идет несколько мутная.
Во вкладке ТКЗ задаете типа такого
УЗЕЛ     30
ВЕТВЬ     0 30-297
ВЕЛИЧИНА  UA IA 3I0
ЗНАЧЕНИЕ  ZL1=(0.46 2.649) RL1=0.46 XL1=2.649 RL0=1.646 XL0=7.933
ФОРМУЛА   #ZE=(UA*1000-IA*ZL1)/3I0
ФОРМУЛА   #RE=MOD(ZE)*COS(ARCTG2(ZE))         
ФОРМУЛА   #XE=MOD(ZE)*SIN(ARCTG2(ZE))
ФОРМУЛА   KR=RE/RL1 KX=XE/XL1
ФОРМУЛА  KKR=KR/((RL0-RL1)/(3*RL1)) KKX=KX/((XL0-XL1)/(3*XL1))         
НСМ       1
ВИД-КЗ    A0   /*ABC или AB(R X) или AВ+BС(R X)*/
УЗЕЛ-КЗ   297
ПОДРЕЖИМ  1
ПОДРЕЖИМ  2
ЭЛЕМЕНТ  3

Находите КR и KX, далее в приказ на расчет ДЗ задаете
ВКЛ_РС Zф
Д_КОМП KR=ваша_цифра1 KX=ваша_цифра2.
Далее считаете, как обычно.
ККr и ККx существуют по той причине, что в терминал вводятся удельные сопротивления линии по прямой и нулевой последовательности, по ним считаются КR и КX (как- см. мануал ЭКРЫ)
Если никаких наводок по нулевой последовательности для вашей линии не имеется, то ККr=1 и ККx=1. Т.е. тогда терминал типа делает всю работу за вас, вы вводите в него параметры линии, вот эти вот единицы - и он к бою готов.

Но для того, чтобы учесть ситуацию, когда, к примеру, у вас есть какая-то параллельная линия, которая никак не компенсируется, нужно перебирать подрежимы и добывать значения КR и КX расчетно (как написано выше). И возникает задача - как совместить те KR и КХ, которые насчитали вы, и те, которые насчитал терминал. Это делается с помощью костылей под названиями ККr и ККx - они равны отношению действительного насчитанного коэффициента к тому, что нашел терминал по данным линии.
Т.е. KRист=KKr*KRтерм, отсюда KKr= KRист/KRтерм. Аналогично с KKx...

%=========
Пояснения:
Как работает метод наложения
Вы знаете, что через линию течет 1000 А, и знаете ее сопротивление, и знаете примерно модуль напряжения на концах линии (что-то около номинала). Обычно рекомендуют с питающего конца брать даже заниженное значение (скажем, 0,9Uном), фаза его роли не играет (начало отсчета) и задается равной нулю. Тогда по закону Ома вы сможете найти напряжение в конце линии (модуль и фазу). Это все делается либо вручную, либо через панель установки режима.

Теперь у вас есть напряжения по модулю и фазе по концам линии в доаварийном режиме. Зная их, можно узнать напряжение в любой точке линии по закону Ома. Тогда, если вы предполагаете КЗ на линии, то доаварийное напряжение в месте КЗ вам уже известно. Доаварийное напряжение Uдоав и ток Iдоав в месте установки защиты известны тоже.

Метод наложения заключается в том, что из схемы выкидываются все ЭДС (вообще ВСЕ), а в место КЗ включается ЭДС, равная доаварийному напряжению, развернутому по фазе на 180 градусов.
Под действием этой ЭДС в схеме текут т.н. чисто аварийные токи, а в узлах имеются чисто аварийные напряжения.
Непосредственно для данного случая нужен чисто аварийные ток Iав/напряжение Uав в начале линии, где стоит защита. К чисто аварийным составляющим прибавляются, опять же, известные доаварийные ток и напряжение через данную линию Iдоав, Uдоав, которые мы знаем.
Таким образом, I=Iдоав+Iав,  U=Uдоав+Uав - расчетные ток и напряжение, которые будут при КЗ через эту линию с учетом нагрузки.
Только сразу предупреждаю, на ТУПИКЕ метод наложения выдает НЕВЕРНЫЙ ответ (АРМС о таких случаях даже предупреждает).

Это важно только при выборе уставки по R.
При расчете скоса ф4 переходное сопротивление, по правде говоря, можно брать практически любым в разумных пределах.
В РУ от ИЦ Бреслера, помнится, приводилось объяснение, каким именно образом выбирать угол скоса, и там предлагалось прозамыкать в нагрузочном режиме линию через разные переходные сопротивления, соединить замеры Z слегка кривоватой линией (эти точки чисто по математике вроде бы лежат на какой-то окружности очень здорового радиуса... хотя могу ошибаться), и отстраиваться уже от этой линии.
На практике "слегка кривоватая линия" (годограф) почти прямая, так что можно тупо взять один замер сопротивления при металлическом КЗ и один - при КЗ через переходное, и отстроить от этих двух точек характеристику срабатывания ДЗ. Величина сопротивления здесь, повторюсь, будет не очень важна, берите на глаз, если не понравилось - переберите несколько вариантов.

Для того и существует метод наложения - чтобы не нужно было ничего "отключать".
Если считать без метода наложения, вам нужно рассчитать эквивалент внешней сети через вкладку "Расчет эквивалентов" (брать две точки - начало и конец линии), получится эквивалентные ЭДС слева, справа + обходная связь. Эту схему надо затем нарисовать отдельно, и далее крутить фазы эквивалентных ЭДС по концам, чтобы у вас в линии было 1000 А.
Сами понимаете, это жутки геморрой и годится разве что для академического интереса. Вместо этого, повторяю, используется метод наложения. Почитайте мой пост #4, там все расписано.
Вот метод наложения

Приказом НАПР-Г задаются ДОАВАРИЙНЫЕ напряжения по концам. Далее АРМС вам сам все рассчитает с учетом этого доаварийного режима (т.е вы просто задаете приказ НАПР-Г и КЗ где-то... и все).
Чтобы найти напряжения по концам, повторяю, нужен просто закон Ома. Вы знаете, что в узле 2 напряжение 220 кВ <0°, и знаете, что по линии течет 1000 А, тогда, зная сопротивление линии, по закону Ома находите, что в узле 3 должно быть напряжение 220 кВ <-5°.
Если лень считать по закону Ома, то есть меню "Задание-панель установки режима". Там вбиваете, что нужно 1000 А по линии и напряжение в ее начале столько-то (на самом деле лучше вбить в начале линии напряжение, меньшее номинала - скажем, 200 кВ). Направление тока должно быть от защиты в линию (потому что иначе замер сопротивления полезет вверх, а не вниз).

Не надо, это вообще не относится к расчетам РЗ.

Если имеется в виду определение сопротивлений R1 R0 X1 X0 которые будут подставляться в формулу, то тут все зависит от того, как будут задаваться уставки.
Как я уже говорил, ККR и KKX - это костыли, одно из поделий программистов якобы "для удобства", их значения зависят от того, что вы введете как R1 R0 X1 X0 в терминал (в то время как КRрасч, KXрасч определяются по модели один раз и далее уже ни от чего не зависят). Сами эти значения R1 R0 X1 X0 никакой смысловой нагрузки не несут, важно, чтобы
KRрасч=KKr*(R0-R1)/(R1) и KXрасч=KKx*(X0-X1)/(X1)  соответствовали тому, что вы насчитали... Ограничение тут только одно - диапазон задания этих четырех сопротивлений 0-100 Ом.
Наверное, в вашем случае лучше все-таки взять за основу параметры участка номер 1. 
Но КЗ при расчете KKr и KKx обязательно делать в конце составной линии!

Ах да, в приказе Д_КОМП используются КR и КX для тока 3I0, а в мануале ЭКРЫ - для тока I0 (но файл приказов, приведенный выше, для расчета KKR и KKX это учитывает).

Это копипаст с какого-то старого расчета. Смысл в том, что расчетные значения ККr и KKx зависят от индуктивных наводок со стороны других параллельных линий. Поэтому нужно найти режим с минимальным их значением (чтобы не было неселективности). Как правило, этому соответствует случай отключения и заземления параллельной линии. В вашем случае, скорее всего, это линия N=82.